Además de los ahorros en el costo, encontramos que las propiedades físicas y químicas del biodiésel son muy similares a los del combustible diésel de petróleo en cuanto a la operación en los motores diésel.
Ventajas
El biodiésel es biodegradable, no es tóxico y está esencialmente libre de azufre y compuestos aromáticos. Es más seguro de manejar y transportar. Produce menos emisiones nocivas que el combustible de petróleo diésel, y se elimina prácticamente la lluvia ácida causada por el dióxido de azufre. Puede funcionar en cualquier motor diésel convencional, sin modificarse el motor. Tiene lubricidad mejorada.
El biodiésel tiene un alto cetanaje (o índice de cetano - un compuesto que contiene 16 átomos de carbono). También tiene mejor conductividad, especialmente en comparación al combustible ultra bajo en azufre. La mejor ventaja es el hecho de que el biodiésel es un combustible renovable, y los combustibles derivados del petróleo son limitados. Por esta razón se hace cada vez más popular.
Desventajas
Tienen menos contenido de energía. El contenido energético del biodiésel puro (100% de biodiésel) es aproximadamente 11% menos que la de combustibles derivados del petróleo diésel, resultando en una pérdida de potencia en el funcionamiento del motor. El ajustar las pérdidas de energía en el motor podría violar las leyes del EPA (Agencia de Protección Ambiental) en los Estados Unidos contra la manipulación de combustibles. El biodiésel se puede mezclar con combustibles derivados del petróleo para crear mezclas de biodiésel que pueden minimizar la pérdida de potencia.
Ocurren problemas con el funcionamiento del motor. Los motores de hoy están diseñados para funcionar con combustibles derivados del petróleo. El biodiésel puro y las mezclas de biodiésel con porcentaje más alto pueden causar una variedad de problemas en el rendimiento del motor, como la obstrucción del filtro del combustible, el coque del inyector (depósitos de carbón) y el anillo del pistón se pega y rompe. También ocurre la inflamación y endurecimiento/rompimiento del elastómero y la degradación severa del lubricante del motor.
Ciertos estudios encontraron que los inyectores y bombas fallaron alrededor de los 50,000 kilómetros al usar el biodiésel puro. Hay poca información sobre el uso de biodiésel con la durabilidad del motor sobre el kilometraje y las condiciones de funcionamiento de los motores diésel de servicio pesado.